2019년 2월 12일 개정된 소득세법 시행령에 따르면 2021년 1월 1일 이후부터 다주택자가 다른 주택을 모두 양도하고 최종 1주택이 된 경우 그 주택의 양도세 비과세를 위한 2년 보유기간은 최종 1주택이 된 날부터 기산함.

또한, 2020년 12월 24일 기재부 유권해석에 따르면, 2021년 1월 1일 전에 다른 주택을 모두 양도 하고 2021년 1월 1일 현재 1세대 1주택이 된 자가 해당 주택을 양도하는 경우 보유기간 기산일은 해당 주택의 취득일 부터 기산함. 이는 비과세를 위한 2년 보유기간을 최종 1주택이 된 날부터 기산하는 개정 규정은 2021년 1월 1일 현재 1주택자 에는 적용하지 않는다는 의미임.

단, 장기보유특별공제 계산시 보유기간 산정은 중간에 다주택 상태가 있었더라도 장기보유특별공제 계산을 위한 보유기간은 취득일부터 기산함. 소득세법 95조 4항을 보면 ‘장기보유특별공제 적용을 위한 보유기간은 취득일부터 양도일까지로 한다’ 고 규정하고 있기 때문임.